最近需要安装ggstatsplot这个包，里面需要安装metaBMA，然后metaBMA又依赖于rstan，于是安装rstan对我的折磨就开始了。以下内容将分享如何在centos7平台安装rstan。

问题描述

安装ggstatsplot时报错，提示metaBMA包安装失败，原因是rstan这个依赖包安装，基于官网trace结果是**caught segfault** address 0x20, cause 'memory not mapped'。装包怎么会有内存错误，开始以为是什么包之间有冲突，没当回事，可是仔细想想显然不可能，于是回过头看报错，发现问题主要在于rstan，rstan虽然安装成功但是编译stan程序会报错，用官网的8school案例测试，同样报错caught segfault。

问题分析

根据github官网上的描述和issue里的内容，问题应该出在编译Rcpp包的gcc版本与编译rstan的gcc版本不同。

解决流程（包括安装rstan全过程）

安装新版本gcc

centos7的预装gcc版本为4.8.5，刚好不满足rstan的最低要求😓。以下为gcc-9.1.0安装流程(一下流程会覆盖gcc，谨慎操作)：

wget http://ftp.tsukuba.wide.ad.jp/software/gcc/releases/gcc-9.1.0/gcc-9.1.0.tar.gz
tar -xzvf gcc-9.1.0.tar.gz
cd gcc-9.1.0
./contrib/download_prerequisites
mkdir build
cd build
../configure --prefix=/usr -enable-checking=release --enable--long-long--with-system-zlib -enable-languages=c,c++,fortran -disable-multilib
# 这样安装会覆盖原有gcc
make -j8
make install
ldconfig -v

安装Rcpp和rstan

进入R，输入以下命令：

dotR = file.path(Sys.getenv("HOME"), ".R")
if (!file.exists(dotR)) dir.create(dotR)
M = file.path(dotR, "Makevars")
if (!file.exists(M)) file.create(M)
cat("\nCXX14FLAGS=-O3 -march=native -mtune=native -fPIC", "CXX14=g++", file = M, sep = "\n", append = TRUE)
install.packages("Rcpp") # 很重要，必须保持一致性编译
Sys.setenv(MAKEFLAGS = "-j8")
install.packages("rstan", type = "source")
install.packages("ggstatsplot")

参考链接： https://github.com/stan-dev/rstan/wiki/Installing-RStan-on-Linux (opens new window) https://github.com/stan-dev/rstan/issues/728 (opens new window)